अतीक अहमद के बेटे के एनकाउंटर पर विपक्ष के नेता कई सवाल खड़े कर रहे हैं। AIMIM के मुखिया असदुद्दीन ओवैसी ने इसे लेकर बीजेपी पर जमकर निशाना साधा है। साथ ही उन्होंने तेलंगाना में एक कार्यक्रम में बीजेपी सरकार के काम के तरीके पर जमकर सवाल भी उठाए हैं। ओवैसी ने जुनैद और नसीर हत्याकांड का जिक्र करते हुए पूछा है कि, “जुनैद और नसीर के मारने वालों को भी गोली मारोगे क्या बीजेपी वालों? जुनैद और नसीर को जिसने मारा क्या तुम उसका भी एनकाउंटर करने वाले हो बीजेपी वालों, नहीं मारोगे तुम।” अपने समर्थकों को संबोधित करते हुए AIMIM के मुखिया असदुद्दीन ओवैसी बेहद गुस्से में भी नजर आ रहे थे। उन्होंने आगे भड़कते हुए कहा कि तुम जुनैद और नासिर को मारने वालों का एनकाउंटर इसलिए नहीं करोगे क्योंकि तुम केवल मजहब के नाम पर एनकाउंटर करते हो। मारों जुनैद औऱ नसीर के कातिलों को। पर नहीं मारोगे, अबतक एक पकड़ा गया और 9 गायब चल रहे है। असद अहमद एनकाउंटर पर मायावती और अखिलेश यादव ने भी सवाल उठाए हैं। मायावती ने ट्वीट कर कहा कि प्रयागराज के अतीक अहमद के बेटे व एक अन्य की आज पुलिस मुठभेड़ में हुई हत्या पर अनेकों प्रकार की चर्चायें गर्म हो गई हैं। लोगों को लगता है कि विकास दुबे काण्ड के दोहराए जाने की उनकी आशंका सच साबित हुई है। अतः घटना के पूरे तथ्य व सच्चाई जनता के सामने आ सके इसके लिए उच्च-स्तरीय जांच होनी जरूरी है।